Der Landkreis Kelheim besteht aus 24 Gemeinden, davon 8 Einheitsgemeinden und 16 Gemeinden in Verwaltungsgemeinschaften.
Einheitsgemeinden
| Ort | Status | Einwohner |
| Abensberg | Stadt | 12.876 |
| Bad Abbach | Markt | 11.413 |
| Kelheim | Stadt | 15.609 |
| Mainburg | Stadt | 14.154 |
| Neustadt /Donau | Stadt | 12.961 |
| Painten | Markt | 2.200 |
| Riedenburg | Stadt | 5.607 |
| Rohr i. NB | Markt | 3.262 |
Verwaltungsgemeinschaften
| Sitz der VG | Ort | Status | Einwohner |
| Ihrlerstein | Essing | Markt | 993 |
| | Ihrlerstein | Gemeinde | 4.142 |
| Langquaid | Hausen | Gemeinde | 2.038 |
| | Herrngiersdorf | Gemeinde | 1.189 |
| | Langquaid | Markt | 5.244 |
| Mainburg | Aiglsbach | Gemeinde | 1.707 |
| | Attenhofen | Gemeinde | 1.357 |
| | Elsendorf | Gemeinde | 2.044 |
| | Volkenschwand | Gemeinde | 1.692 |
| Saal/Donau | Saal/Donau | Gemeinde | 5.272 |
| | Teugn | Gemeinde | 1.600 |
| Siegenburg | Biburg | Gemeinde | 1.185 |
| | Kirchdorf | Gemeinde | 888 |
| | Siegenburg | Markt | 3.426 |
| | Train | Gemeinde | 1.849 |
| | Wildenberg | Gemeinde | 1.331 |
Stand 31.12.2011 |
| Bevölkerung |
| Einwohner insgesamt | 114.039 |
| Bevölkerungsdichte | ca. 107 Einw/km² |
| |
| Geographie |
| Landkreisfläche | 1066,90 km² |
| Landwirtschaftsfläche | 536,91 km² |
| Waldfläche | 416,99 km² |
| Wasserfläche | 14,40 km² |
| Sonstiges (Verkehrsfl./bebaute Fl.) | 46,50 km² |
| Naturschutzgebiete | 14,49 km² |
| Landschaftsschutzgebiete | 230,84 km² |
| Schutzzone Naturpark Altmühltal | 140,40 km² |
| Natur- und Landschaftsschutzfl. insgesamt | ca. 23 % der Landkreisfläche |
| Stand 31.12.2011 |
Beteiligungen des Landkreises
Zweckverband Kreissparkasse Kelheim
Zweckverband Sparkasse Rottenburg a. d. L.
Regionaler Planungsverband der Region Regensburg
Regionaler Planungsverband der Region Landshut
Zweckverband Häfen im Raum Kelheim
Zweckverband Bad Gögging
Zweckverband zur Förderung des Kurbetriebes in Bad Abbach
Zweckverband Kurmittelhaus Bad Abbach
Zweckverband Müllverwertungsanlage Ingolstadt
Rettungszweckverband Landshut
Zweckverband Tierkörperbeseitigung Scheuermühle
Zweckverband für Tierkörper- und Schlachtabfallbeseitigung Plattling, Sitz Deggendorf
Zweckverband Bayerische Landschulheime
Trägerverein Altmühltal e.V.
Landschaftspflegeverband Kelheim VöF e.V.
Donaupark-Wirtschaftsentwicklungs GmbH
Planungsverband Donaupark